Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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CLDN15P56746 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CLDN15P56746 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLDN15P56746 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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