Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HADHBP55084 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HADHBP55084 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms