Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VEGFBP49765 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms