Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIP4K2AP48426 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms