Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK1P39086 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GRIK1P39086 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
GRIK1P39086 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GRIK1P39086 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIK1P39086 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIK1P39086 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GRIK1P39086 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GRIK1P39086 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GRIK1P39086 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms