Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PPARGP37231 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms