Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA13P31271 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA13P31271 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms