Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ERCC2P18074 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ERCC2P18074 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ERCC2P18074 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ERCC2P18074 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERCC2P18074 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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