Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms