Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED1O96006 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ZBED1O96006 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED1O96006 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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