Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F8A0AVK6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms