Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
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