Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PHF8Q9UPP1 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms