Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNFSF18Q9UNG2 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms