Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CYP39A1-205ENST00000619708 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ASNS-203ENST00000394309 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RCAN1-214ENST00000620920 2257 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms