Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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