Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP2A3Q93084 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms