Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHF3Q92576 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHF3Q92576 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms