Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSRNP3Q8WYN3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms