Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BEST2Q8NFU1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms