Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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RNF148Q8N7C7 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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