Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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TCF23Q7RTU1 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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TCF23Q7RTU1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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TCF23Q7RTU1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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TCF23Q7RTU1 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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TCF23Q7RTU1 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TCF23Q7RTU1 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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