Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PRAMEF20Q5VT98 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PRAMEF20Q5VT98 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PRAMEF20Q5VT98 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PRAMEF20Q5VT98 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PRAMEF20Q5VT98 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PRAMEF20Q5VT98 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PRAMEF20Q5VT98 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PRAMEF20Q5VT98 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PRAMEF20Q5VT98 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms