Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ALAS1-201ENST00000310271 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LMOD3-202ENST00000475434 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GRB10-202ENST00000357271 2050 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf27-203ENST00000419367 1900 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRE5-203ENST00000358600 2751 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 VPS16-202ENST00000380445 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NRG1-212ENST00000521670 1769 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AP003355.2-201ENST00000605923 2622 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA0040-203ENST00000545251 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF766-202ENST00000593612 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KLK10-203ENST00000391805 3006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RGL4-210ENST00000615003 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN30-211ENST00000610712 3439 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02140-202ENST00000566649 2017 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TP53-201ENST00000269305 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TP53-226ENST00000620739 2579 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RAET1K-202ENST00000533735 1883 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GUCY1A3-207ENST00000511108 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEB16-202ENST00000399987 1736 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms