Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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CUL3Q13618 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CUL3Q13618 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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