Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF5Q13243 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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