Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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FOXF1Q12946 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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FOXF1Q12946 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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