Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CALD1Q05682 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms