Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TPM4P67936 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TPM4P67936 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TPM4P67936 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms