Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIK1P39086 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK1P39086 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK1P39086 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms