Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCR5P32302 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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