Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1P21675 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1P21675 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1P21675 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1P21675 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1P21675 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1P21675 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1P21675 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1P21675 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1P21675 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1P21675 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1P21675 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1P21675 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1P21675 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1P21675 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1P21675 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1P21675 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1P21675 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1P21675 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1P21675 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1P21675 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1P21675 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms