Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF4P18085 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF4P18085 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms