Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD8P13378 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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