Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLTBP09497 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLTBP09497 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLTBP09497 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLTBP09497 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLTBP09497 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLTBP09497 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLTBP09497 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLTBP09497 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLTBP09497 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLTBP09497 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLTBP09497 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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