Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VTNP04004 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VTNP04004 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VTNP04004 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VTNP04004 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VTNP04004 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VTNP04004 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VTNP04004 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VTNP04004 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VTNP04004 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VTNP04004 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VTNP04004 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VTNP04004 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VTNP04004 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms