Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KIF4AO95239 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms