Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SCN2BO60939 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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