Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms