Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms