Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00312Q9Y6C7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00312Q9Y6C7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms