Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TCAF1Q9Y4C2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TCAF1Q9Y4C2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCAF1Q9Y4C2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms