Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A6Q9Y2P4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms