Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC3AQ9Y2H6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms