Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGSF9BQ9UPX0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGSF9BQ9UPX0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms