Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO1Q9UM00 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO1Q9UM00 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms