Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRID1Q9ULK0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms