Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRFN2Q9ULH4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRFN2Q9ULH4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRFN2Q9ULH4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms