Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PADI1Q9ULC6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PADI1Q9ULC6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PADI1Q9ULC6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 929.7 ms