Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXL4Q9UKA2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXL4Q9UKA2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms